华大基因公布“粮食杀手” 利用基因组数据推动草地贪夜蛾科学防治

时间:2019-07-27 来源: 社会新闻

近日,华达基因发布新闻报道,深圳华大生命科学研究院与云南农业大学联合领导与中国科学院动物研究所,广东省农业科学院,青岛农业大学共同成立研究团队。中国的Spodoptera frugiperda全基因组测序研究,以及最近完成的基因组构建,是世界上第一个发表高质量染色体水平基因组的草地贪夜蛾(Spodoptera frugiperda)。

据华达基因介绍,该研究小组目前正在进一步研究草地贪夜蛾(Spodoptera frugiperda),包括进一步研究抗农药的分子机制,研究小组希望进一步与中国更多相关研究机构合作进行充分探索。利用基因组数据促进斜纹夜蛾的科学防治,提高防治效果,减少可能的危害。

据了解,草地贪夜蛾(Spodoptera frugiperda)是联合国粮食及农业组织(FAO)跨境迁徙农业的主要害虫。它已经对全世界近100个国家和地区造成了作物损害。

同时,由于目前控制过程的发现,蝗虫蛾具有明显的抗性,在中国没有注册农药来控制害虫。因此,蝗虫蛾已经引起了中国目前的农业和粮食生产安全。严重的威胁。我们不需要通过包括基因组学在内的尖端科学研究加深对这一物种的了解,以找到控制入侵物种根源的关键途径。

今年5月,为应对草地贪夜蛾(Spodoptera frugiperda)的快速发展,国内多家单位联合成立了研究小组,迅速开展样品采集和基因测序工作。 6月,农业和农村事务部召开视频会议,宣传国内草原蠕虫的防治工作。农业和农村事务部长韩长赋在会上强调,各级农业和农村部门要把对中国斜纹夜蛾属的防治作为当前农业和农村工作的一项重要任务,进行全面监测。预警,及时有效处置,确保蝗虫不大规模迁徙,大规模连续灾害,坚决打赢蝗虫飞蛾,充分保障粮食和农业生产安全。

基于华大集团华达智卓自主研发的基因测序仪(MGISEQ-2000),研究小组在4天内完成了单长段长基因全序列测序(stLFR技术)和染色体构象捕获测序(Hi-C)。获得样本。 ),并在两周内完成数据分析,完成了世界上第一个草地贪夜蛾(Spodoptera frugiperda)染色体的基因组装配,超过了目前在基因组完整性和基因组完整性方面的成就。在同一时期,全基因组测序由两种来自云南和广东的草地贪夜蛾(Spodoptera frugiperda)进行。公布的数据包括两只雌性和一只雄性蛾的完整基因组数据。总体数据量超过1.5 Tb。

尽管联合研究小组制定的总体研究计划仍在进行中,但目前基因组测序的进展为预防和控制有害生物提供了一些有用的信息。

在构建的草地贪夜蛾基因组中,研究小组发现细胞色素p450和谷胱甘肽巯基转移酶基因家族在该物种的基因家族中严重扩增,细胞色素p450基因家族与解毒功能密切相关。据推测,它主要控制其高度杂食性,谷胱甘肽巯基转移酶基因家族与耐药性密切相关,推测其主要驱动其抗药性。

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